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文献解读丨不做实验，蛋白组纯生信照样发SCI
摘要：今天分享的一篇发表在《Andrology》的文章。文章作者是南方医科大学附属第三医院的泌尿系医生，他们主要通过蛋白质组学分析方法从人精浆里发现了外泌体，有助于日后进一步筛选出治疗雄性不育和前列腺癌的生物标志分子。
今天分享的一篇发表在《Andrology》的文章。文章作者是南方医科大学附属第三医院的泌尿系医生，他们主要通过蛋白质组学分析方法从人精浆里发现了外泌体，有助于日后进一步筛选出治疗雄性不育和前列腺癌的生物标志分子。
IF=2.86，3区期刊
文章大致思路
简单介绍一下文章的研究结果
为了鉴定外泌体的存在，作者首先用western blot鉴定了外泌体标记蛋白HSP70和CD81。TEM结果显示，精浆外泌体有一层脂质双层膜。这些数据可证明外泌体成功地从精浆分离和纯化出来。
随后，作者用LC-MS/MS蛋白质组学分析了精浆外泌体蛋白成分。作者在两组中鉴定出1474个蛋白。当中有24%是重叠蛋白，包括ALIX、HSP70、ACTB、GAPDH、PHGDH、LGALS3P、SEMG1。然后作者又通过生信方法对非重叠蛋白做富集分析，分析其细胞成分。结果发现。大部分蛋白与外泌体、溶酶体和胞浆有关，表明这些非重叠蛋白很可能源自于精浆外泌体。然后GO分析了这些外泌体的功能，都跟代谢、细胞生长与修复、转运有关。
看了一遍大致上流程是不是觉得自己可以做了呢。概括而言，作者用了LC-MS/MS蛋白质组学分析了精浆蛋白后也就只用了简单的GO和KEGG方法做了富集分析。分析方法简单，操作起来也简单，所以就能轻松发表在2-3分期刊了。
如果有朋友还对生信工具不太熟悉，跟着我们一起学习吧~
IF=2.86，3区期刊
文章大致思路
简单介绍一下文章的研究结果
为了鉴定外泌体的存在，作者首先用western blot鉴定了外泌体标记蛋白HSP70和CD81。TEM结果显示，精浆外泌体有一层脂质双层膜。这些数据可证明外泌体成功地从精浆分离和纯化出来。
随后，作者用LC-MS/MS蛋白质组学分析了精浆外泌体蛋白成分。作者在两组中鉴定出1474个蛋白。当中有24%是重叠蛋白，包括ALIX、HSP70、ACTB、GAPDH、PHGDH、LGALS3P、SEMG1。然后作者又通过生信方法对非重叠蛋白做富集分析，分析其细胞成分。结果发现。大部分蛋白与外泌体、溶酶体和胞浆有关，表明这些非重叠蛋白很可能源自于精浆外泌体。然后GO分析了这些外泌体的功能，都跟代谢、细胞生长与修复、转运有关。
看了一遍大致上流程是不是觉得自己可以做了呢。概括而言，作者用了LC-MS/MS蛋白质组学分析了精浆蛋白后也就只用了简单的GO和KEGG方法做了富集分析。分析方法简单，操作起来也简单，所以就能轻松发表在2-3分期刊了。
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