2018年国自然基金评审结果已经新鲜出炉,其中医学科学部共计有9830项获得了基金委资助。从数据来看,热门的几个方向依然火热:外泌体、非编码RNA、表观遗传、肠道菌群、m6A、CRISPR/Cas9技术等。其中,涉及到外泌体的研究项目就有将近400项,今天我们就来介绍一下以外泌体为主题如何发3分多的文章。
首先,关于外泌体,你了解多少呢?
1、外泌体的大小:直径约40-150nm
2、来源:人体几乎所有类型的细胞均能产生外泌体
3、除了外泌体之外细胞还会分泌微泡以及其他的膜囊泡
4、数量:人体中大约有1014个外泌体,几乎平均每个细胞产生1000-10000个
5、存在:存在于几乎所有的细胞组织、体液、细胞间隙中
6、外泌体具有异质性,即使是同一种细胞分泌的外泌体都有可能具有很大的功能区别
7、相关成分:外泌体中含有核酸,同时还有一些蛋白和脂质类物质
参考资料:
标题:Proteomic Profiling Exosomes from Vascular Smooth Muscle Cell
期刊:Proteomics-Clinical Applications ( Proteom Clin Appl )
IF:3.567
见刊时间:2018年5月24日
关键词:外泌体、血管平滑肌细胞、串扰、纳米脂质体、血管生成
研究思路:1、本篇文章主要剖析了血管平滑肌细胞(VSMC)中分泌的蛋白组与外泌体,作者采用人体VSMC细胞系T/G-H-VSMC作为细胞来源,进行细胞培养,之后离心收集并处理,用透射电子显微镜(TEM)分析,确定外泌体小泡的大小在正常范围内,这些形态和大小分析证实了分离的胞外小泡(EVs)是外来体。
之后用凝胶消化法来分析VSMC中衍生出的外泌体中的蛋白质,并用LC/MS/MS法分析样品,此外,采用Western印迹法检测另一种外来体标记物Alix的表达。
2、作者又结合生信分析对VSMC衍生的外泌体中发现的蛋白质进行了全面的分析,鉴定了261种新蛋白质。
之后作者为了鉴定VSMC来源的外泌体中的蛋白质是否与癌细胞来源的外泌体中的蛋白质不同,进行了数据比较,发现只有24种蛋白与作者在T/G Hs-VSMC衍生的外泌体中鉴定的蛋白质相同。
作者又进行了GO分析发现所鉴定的蛋白质参与120个分子功能,337个生物过程,并且是179个细胞组分的一部分。且发现VSMCs通过分泌外泌体调节血小板行为,来调节血管中的血栓形成。
3、作者又进一步研究了VSMC分泌的外泌体在体内新生血管中的作用,通过设计动物实验来验证,结果表明VSMC分泌的外泌体的主要功能可以通过介导VSMC-EC粘附来维持血管稳态。
我们可以看到,整篇文章的工作量小,分析也很少,且注重定性分析,在只有定性分析的情况下文章能发表这个分数还是不错的,那是为什么呢,我们来看一组数据:
图片来源文献:Schey K L,Luther J M,Rose K L.Proteomics Characterization of Exosome Cargo[J].Methods,2015,87:75-82.
该图片显示了截至2014年来关于外泌体的数据统计,这告诉了我们什么呢?紧跟热点!同样的道理,生信分析这个套路刚成为热点的时候,只做数据分析就能发一篇不错的文章,现在做生信分析除了做数据分析之外,必须结合实验验证才能发一篇低分文章。
所以我们要紧跟科研热点,这样才不至于被科研“潮流”所抛弃,自己也能随时吸收新的知识,为自己更好的创新性研究打下基础。
我们会经常给大家介绍一些行业内的最新资讯,相信如果你的文章有创新点,一定会加分不少。
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